Fener Rum Patrikhanesi, Doğu Ortodoks Hristiyanlığının manevi merkezidir. Dünya genelindeki yaklaşık 300 milyon Ortodoks arasında "eşitler arasında birinci" sayılan Ekümenik Patrik'in makamı buradadır. Yerleşkenin kalbindeki ibadet mekânı ise Aya Yorgi (Aziz Georgios) Kilisesi'dir.

1453'te İstanbul'un fethinden sonra Patrikhane birkaç kez yer değiştirdi; Ayasofya camiye çevrilince önce Havariyyun, ardından Pammakaristos (Fethiye) Kilisesi kullanıldı. Patrikhane 1601'de bugünkü Fener'deki yerine yerleşti. Bugünkü kilise, yangınların ardından 18. yüzyıl başında yeniden inşa edildi ve 19. yüzyılda elden geçirildi. Osmanlı döneminde gayrimüslim yapıların gösterişsiz tutulması geleneği nedeniyle dıştan sade görünen bina, içeride son derece zengindir.

İçeride altın yaldızlı ahşap ikonostasis, Bizans işi ikonalar ve Aziz Yuhanna Krisostomos'a atfedilen patriklik tahtı görülür. Kilise, Kilise Babaları Aziz Gregorios Nazianzenos ile Aziz Yuhanna Krisostomos'un ve Azize Efimia gibi azizelerin kutsal emanetlerini barındırır; ayrıca İsa'nın kırbaçlandığı sütunun bir parçası olduğuna inanılan mermer de burada saklanır.

En çarpıcı ayrıntı ana giriş kapısındadır: 1821'de burada asılan Patrik V. Gregorios'un anısına Orta Kapı kaynakla kapatılmış ve bir daha açılmamıştır. Fener'in dar sokaklarında, tarihî Rum mahallesinin ortasında yer alan bu sessiz avlu, kentin en canlı manevi mirası olmayı sürdürüyor.